在合同纠纷中，电子证据的效力认定需综合多方面因素。根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，电子数据属于法定证据种类之一。电子证据的真实性是认定其效力的关键，可从电子证据的生成、存储、传输过程是否可靠，是否存在被篡改、伪造的可能等方面判断。例如，通过可靠的电子签名、可信时间戳等技术手段生成的电子合同，其真实性相对较高。电子证据的合法性要求其收集、获取方式符合法律规定，以侵害他人合法权益或者违反法律禁止性规定的方法取得的电子证据，不能作为认定案件事实的依据。电子证据的关联性要求其与待证事实之间存在逻辑联系，能够证明案件中的相关事实。在认定电子证据效力时，法院或仲裁机构会结合案件具体情况，综合判断电子证据的真实性、合法性和关联性。同时，若对方对电子证据提出异议，主张电子证据有效的一方需承担举证责任，证明电子证据的真实性、合法性和关联性。​

案例：甲公司与乙公司通过电子邮件签订合同，后因合同履行发生纠纷。甲公司以电子邮件合同作为证据主张权利，乙公司则称该电子邮件合同可能被篡改，对其真实性提出异议。​

法律分析：在本案例中，甲公司需举证证明电子邮件合同的真实性。若甲公司能提供证据证明该电子邮件是通过正规邮件系统发送和接收，且邮件内容未被篡改，如提供邮件服务器的相关记录、时间戳证明等，那么该电子邮件合同具有较高的真实性，可作为认定案件事实的重要证据。若甲公司无法证明其真实性，该电子邮件合同的效力将受到质疑，可能无法作为支持甲公司主张的有效证据。​

律师建议：在合同签订及履行过程中，若涉及电子证据，要采用可靠的电子手段，如使用具有电子签名功能的正规合同签署平台、可靠的电子邮件系统等，确保电子证据的生成和存储可靠。对于重要的电子证据，可进行公证或采用第三方存证等方式，增强其证据效力。若在合同纠纷中使用电子证据，要提前准备好能够证明电子证据真实性、合法性和关联性的相关材料。若对方对电子证据提出异议，要积极应对，通过专业技术鉴定、提供相关辅助证据等方式，维护电子证据的效力。同时，企业应建立完善的电子证据管理制度，规范电子证据的收集、存储和使用，以便在纠纷发生时能够有效运用电子证据维护自身权益。