在合同履行中，一方能否以另一方未开具发票为由拒绝支付款项，需依据合同约定及法律规定判断。若合同明确约定先开具发票后支付款项，当一方未按约定开具发票，另一方有权行使先履行抗辩权，拒绝支付款项，直至对方开具发票。例如，甲、乙公司在买卖合同中约定，乙公司收到货物后 10 日内开具发票，甲公司收到发票后 5 日内支付货款，若乙公司未按时开具发票，甲公司可拒绝付款。然而，若合同未明确约定付款与开具发票先后顺序，且开具发票并非合同主要义务，仅为附随义务，一般情况下，不能以未开具发票为由拒绝支付款项，因为支付款项是合同主要义务，二者不具有对等性。但在某些特殊行业或地区，若法律、行政法规明确规定开具发票与支付款项存在特定关联，从其规定。​

案例：丙公司与丁公司签订建筑工程施工合同，合同未约定付款与开具发票顺序。工程竣工后，丁公司要求丙公司支付剩余工程款，丙公司以丁公司未开具已付款项发票为由拒绝支付。​

法律分析：本案例中，合同未约定付款与开具发票先后顺序，开具发票是附随义务，支付工程款是主要义务，丙公司不能仅以丁公司未开具发票为由拒绝支付剩余工程款。若丙公司因未取得发票遭受税务损失等，可另行主张赔偿，但不能以此对抗付款义务。若建筑行业相关法规或当地政策对发票与工程款支付有特别规定，按规定处理。​

律师建议：合同双方签订合同时，应明确约定付款与开具发票先后顺序及相关违约责任，避免纠纷。若合同未约定，付款方不能随意以未开具发票为由拒绝支付款项，若因发票问题遭受损失，可通过协商或法律途径解决。收款方要及时按约定或交易习惯开具发票，避免因未开具发票影响款项回收，若对方不合理拒付，可主张其履行付款义务。同时，企业要规范财务管理，重视发票开具与收取，降低税务风险及合同纠纷风险。​